Генерал -- совершенно легитимно, конечно. У большинства читателей сразу же возникнут ассоциации с генералом ордена иезуитов, так что и францисканцы вполне встанут в ряд. Глава -- вполне нормально, это по смыслу верно, а генерал -- принятая титулатура для некоторых орденов по-русски, насколько я понимаю.